Een goede vergelijking van de voordelen en mogelijkheden van de verschillende alternatieven is alleen mogelijk als gekeken wordt naar de totale kosten en alle milieu-effecten. Dus ook naar de kosten en milieugevolgen van het winnen van de grondstoffen, de productie en distributie van de brandstof en de productie van apparatuur, motoren en auto’s. Dat hele trajact noemen we ook wel: from well to wheel, ofwel van (olie)bron tot en met auto.
Als men kijkt naar die totale keten dan zou de conclusie kunnen zijn, dat waterstof momenteel nog niet het meest optimale alternatief is. De productie van waterstof uit echt duurzame bronnen als wind-, getijde- of zonne-energie is kostbaar en voor de productie van brandstofcellen, waterstofauto’s en apparatuur voor tankstation zijn soms duurdere materialen nodig. Bovendien is de vraag nog zodanig klein, dat er nog niet in grote aantallen geproduceerd kan worden, zodat apparatuur en auto’s voorlopig relatief duur blijven.
Daarnaast zijn er grote verschillen in de kosten voor logistiek en de distributie. Traditionele brandstoffen en alternatieve brandstoffen voor de traditionele verbrandingsmotor, kunnen gebruik maken van de bestaande infrastructuur en techniek. Nieuwe alternatieven brengen wat dat betreft grote investeringen met zich mee. Bij het gebruik van gasvormige brandstoffen als LPG, aardgas en waterstof, die onder hoge druk vloeibaar gemaakt moeten worden, zijn ook de kosten voor veiligheidsvoorzieningen hoger.
Aan de andere kant lopen de kosten voor het winnen van de traditionele brandstoffen gestaag op omdat de voorraad afneemt en de winning steeds moeilijker wordt. Ook de kosten voor het transport, de productie en het milieuvriendelijk maken van de brandstoffen en voertuigen met verbrandingsmotoren worden steeds hoger. Om nog maar niet te spreken van de kosten voor de maatschappij, die veroorzaakt worden door de gevolgen van de luchtvervuiling en de klimaatverandering. Als al die kosten en ontwikkelingen in aanmerking genomen worden, zou het beeld wel eens snel kunnen omslaan.
