Het gebruik van waterstof in combinatie met een brandstofcel levert een enorme reductie van de schadelijke uitstoot op. In de voorbereiding van het HyMove-project is die vermindering berekend. Daarbij is uitgegaan van een gemiddeld aantal kilometers per jaar van 75.000 voor een bus die in de dienstregeling rijdt, 25.000 voor een personenauto en 35.000 voor een vrachtauto. In de berekening van de vermindering van de emissies is uitgegaan van de uitstoot van vergelijkbare voertuigen op benzine en diesel.
| CO2 (kg) | NOx (kg) | Fijnstof (kg) | |
| 1 bus | 65.000 | 375 | 3 |
| 4 personenwagens | 20.000 | 30 | 1 |
| CO2 (kg) | NOx (kg) | Fijnstof (kg) | |
| 4 bussen | 260.000 | 1.500 | 12 |
| 6 personenwagens | 30.000 | 45 | 2 |
| 2 vrachtwagens | 70.000 | 420 | 14 |
| CO2 (kg) | NOx (kg) | Fijnstof (kg) | |
| 100 bussen | 6.500.000 | 37.500 | 300 |
| 40 personenwagens | 200.000 | 300 | 10 |
| 40 vrachtwagens | 1.400.000 | 8.400 | 280 |
Ook prognoses van het Europese HyWays-project komen voor de lange termijn uit op flinke reducties. De grootschalige overgang naar waterstof kan volgens deze organisatie in 2050 al tot een vermindering van 50% van de CO2 uitstoot door het verkeer leiden met alle gunstige gevolgen voor het klimaat en de luchtkwaliteit.